单细胞测序是只测一个细胞吗

作者：小柯

近日，西班牙巴塞罗那科技学院的Holger Heyn及其研究团队对单细胞RNA测序实验方案进行了基准测试，这一研究于2020年4月6日在线发表在《自然—生物技术》杂志。

单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）是目前表征样品中单个细胞转录组的主要手段。最新的实验方案能够扩展到数千个细胞，为绘制、器官和生物体的细胞图谱提供了有力支持。

这些实验方案在RNA捕获效率、偏倚、规模和成本方面存在显著差异，且在不同应用中的相对优势尚不清楚。为了解决这个问题，研究团队生成了基准数据集，系统性地评估了各种实验方案在描述细胞类型和状态方面的能力。

为了更深入地了解这些实验方案的性能，研究团队进行了一项多中心研究，比较了13种常用的scRNA-seq和单核RNA-seq实验方案。结果显示，这些实验方案在文库的复杂性以及检测细胞类型标记的能力上存在明显差异，这进一步影响了它们的预测价值和与参考细胞图谱的整合适用性。

这项研究为独立研究人员和团队研究项目（如人类细胞图谱计划）提供了宝贵的指导。对于想要了解这一领域的读者，可以查阅相关的论文，链接如下：www./articles/s41-4。关于此报道的详细内容，可以访问news./htmlpaper/2020/4/031855776.shtm进行了解。